Endometrioza ovarian, de asemenea, numit endometrioma, se datorează prezenței țesutului endometrial, glande endometriale și țesuturi stromale care trebuie să fie numai în interiorul uterului, acoperind și ovar. Doctorul poate constata că femeia are endometrioză în ovar prin ultrasonografia transvaginală, care detectează în principal un chist în ovar cu mai mult de 2 cm plin de lichid închis.