Tratamentul pentru fenilcetonurie consta dintr-o dietă cu conținut redus de fenilalanină, care este un aminoacid care se acumuleaza in sange fenilcetonuriei, cauzand probleme, cum ar fi retard mintal și convulsii . Fenilcetonuria nu are nici un tratament și nu există nici un medicament pentru această boală, și în timpul tratamentului este necesar să se monitorizeze periodic valorile fenilalaninei în sânge.